Sebelum tahun 1947 ada beberapa kelurahan yang ada di Desa Banjaroyo yaitu kelurahan Kalibawang (meliputi Pedukuhan Pantog Wetan, Pantog Kulon, Banjaran, dan Slanden); kelurahan Klangon (meliputi Pedukuhan Klangon, Pranan, Potronalan, Beji, dan Kempong); Kelurahan Tanjung (meliputi Pedukuhan Tanjung, Duren Sawit, Plengan, dan Dlingseng); dan Kelurahan Tonogoro (meliputi Pedukuhan Semawung, Promasan, Semagung, Kajoran, Tonogoro, dan Puguh) dan pada tahun 1947 disatukan menjadi Desa Banjaroyo.
Sejak tahun 1947 Pemerintah Desa Banjaroyo telah mengalami beberapa kali pergantian Kepala Desa, yaitu:
- Tahun 1947-1957 oleh R. Djojo Atmojo
- Tahun 1957-1976 oleh Suto Harjo
- Tahun 1976-1996 oleh Darmo Suyitno
- Tahun 1996-2004 oleh R. Subadri
- Tahun 2004-2013 oleh B. Wiwin Windarta
- Tahun 2014-2020 oleh Anton Supriyono